不同错合畸形矫治的最佳年龄有所不同。
在乳牙期（3～5岁）和替牙期（6～11岁），一般的错合畸形如个别牙齿错位不需要立即矫治，应当继续观察和纠正口腔不良习惯，因为在这个时期，牙颌正处于调整时期，随着不良习惯的纠正，错颌畸形常可以部分自行纠正，但是，对于严重妨碍生长发育的错颌畸形，则需要进行一期的矫治，如乳牙反颌，会妨碍上颌骨的发育，影响面部的外形，应当及早治疗。如果孩子能配合，在3～5岁都可矫治。又如严重下颌后缩，在替牙期（7～10岁）就可进行早期矫治，以阻断其向严重发展， 也为以后继续矫治减小难度。 大多数的错颌畸形要等到牙齿替换完的恒牙期，大约12～14岁才进行矫治。因为这时恒牙牙根逐渐发育完成，上下牙齿间的咬合关系也调整完成，可以对错颌畸形的类型做出明确诊断，并采取相应的矫治方法。矫治完成后容易保持稳定的效果，不会再有大的变化。
从理论上讲，儿童矫治错颌畸形的最佳年龄是在儿童的生长发育高峰期。男孩在12～14岁，女孩在11～13岁。但是每个儿童的生长发育又有个体差异，不能一概而论。正确的方法是通过一定的检测手段来估计生长发育的高峰期。如拍手腕X线片、连续测量身高、了解女性的月经初潮、留心儿童的鞋袜衣帽等。在这个时期进行矫治，疗程短，效果好。
如果错过恒牙初期，如到了15～17岁，仍处于青少年期，生长发育仍然比较活跃，虽然难度略有增加，但矫治效果也比较好。如果到了18岁以后，进入成人期，生长发育基本完成，矫治速度效果就不如儿童期和青少年期，但是现代矫正技术的发展使成人正畸也不是障碍了。对于严重的骨性错颌畸形，不能单纯用正畸的方法来完成矫治，必须等到18岁以后的成人期配合外科手术来进行治疗。
